Tout l'équipage de l'Enterprise-A a quitté
le service actif depuis 2292 (sauf Sulu). En 2293, la lune Klingonne Praxis
explose. Or, cette lune est le fournisseur exclusif de l'énergie de
tout l'Empire Klingon, et en particulier, de la planète mère:
Qo'noS. Selon la Fédération, il reste 50 ans à vivre
à l'Empire Klingon. La Fédération profite donc de cette
faiblesse pour proposer un traité de paix aux Klingons, sur l'initiative
de l'ambassadeur Spock. Le chancelier Klingon Gorkon est invité par
la Fédération et c'est l'Enterprise-A qui est choisi
pour escorter son vaisseau. Kirk et son équipage reprennent donc du
service pour une dernière mission, malgré les sentiments que
Kirk éprouve encore envers les Klingons pour la mort de son fils.
Par diplomatie, les officiers du croiseur Klingon sont invités à
bord de l'Enterprise-A pour un dîner officiel dont l'ambiance
reste très tendue. Peu après le retour des officiers Klingons
à bord du croiseur, deux torpilles frappent ce dernier et détruisent
le système gravité artificielle. Deux assassins en scaphandre
profitent de la panique pour tuer le chancelier Klingon, Gorkon. Kirk et Mc
Coy arrivent à leur tour sur le vaisseau Klingon et essaient de sauver
Gorkon, mais en vain. Accusés de meurtre, ils sont transférés
sur la colonie pénitentiaire de Ruhra Pente. Pendant ce temps, Spock
et le lieutenant Valeris mènent l'enquête à bord de l'Enterprise-A
pour découvrir qui sont les assassins et qui a réellement tiré
sur le croiseur de Gorkon. Scotty découvre les combinaisons et les
bottes magnétiques des assassins ... qui sont retrouvés morts. Pendant
ce temps l'Enterprise-A se dirige vers la colonie de Ruhra Pente pour
tenter d'y récupérer Kirk et McCoy. L'opération est un
succès
Kirk est sûr d'un complot visant à empêcher la signature
tu traité de Paix. Il contacte Sulu, capitaine de l'USS Excelsior,
pour connaître le lieu de la conférence de paix. Les deux vaisseaux
foncent alors droit sur Khitomer. A bord de l'Enterprise-A, Kirk et
Spock tedent un piège afin de capturer le traître à bord.
Il s'agit de Valeris, qu'un rapport mental forcé fait avouer. Il s'avère
que la conspiration met en cause des amiraux de Starfleet et des généraux
Klingons. En arrivant à Khitomer les deux vaisseaux sont attaqués
par un prototype d'Oiseau de Proie, capable de tirer en restant camouiflé.
Avec l'aide de l'Excelsior, l'Enterprise-A parvient à
détruire le prototype. Kirk se téléporte alors sur Khitomer
et sauve juste à temps le Président de la Fédération
d'un tireur. Le traité de Khitomer est finalement signé.
L'Excelsior repart alors qu'un message du haut commandement de Starfleet
parvient à l'Enterprise-A pour annoncer son démantèlement
définitif. L'heure de la retraite a cette fois vraiment sonné.