Grâce au succès de leur dernière mission,
Kirk et son équipage ont sauvé la Terre. En remerciement, le
Conseil de la Fédération a levé toutes les charges pour
tous les membres d'équipage sauf Kirk: une seule charge est retenue
contre lui (sur les 9 initiales). Il se retrouve donc dégradé
au rang de Capitaine et se voit confier le commandement d'un nouveau vaisseau:
l'
USS Enterprise-A.
En 2287, la Fédération, l'Empire Klingon et l'Empire Romulien
essaient de se rapprocher en cohabitant sur la planète Nimbus III.
Mais un étrange Vulcain, Sybok, attaque la capitale et réclame
à la Fédération un vaisseau pour aller sur la planète
qu'il pense être le Paradis. Kirk et son équipage sont envoyés
pour résoudre la situation à bord du nouvel
Enterprise-A,
dont la mise au point n'est même pas terminée.
En arrivant sur place, Kirk monte une équipe de sauvetage pour délivrer
les trois otages. Mais en arrivant sur place, les otages refusent de partir
: ils semblent attachés et fidèles à Sybok. Lorsque ce
dernier apparaît, Kirk et son équipe sont faits prisonniers.
Sybok oblige Kirk à le transporter, lui et ses hommes à bord
de l'
Enterprise-A. Kirk effectue une manoeuvre inattendue et écrase
la navette dans le hangar du vaisseau. Sous le choc, Sybok a lâché
son arme; Spock s'en saisit mais ne tire pas sur Sybok, malgré l'ordre
de Kirk. Sybok et ses hommes les mettent en cellule. Furieux, Kirk demande
des explications à Spock qui lui explique que Sybok est son demi frère
: le fils de Sarek et de sa première femme. Sybok est une exception
: un Vulcain régi par ses émotions et dont la vie a été
tournée vers un seul but : trouver l'Eden.
Alors que Scotty parvient à faire échapper Kirk Spock et Mc
Coy, ces derniers retrouvent Sybok qui leur explique leur mission : traverser
la barrière d'énergie qui entoure le coeur de la Galaxie pour
atteindre la planète de l'Eden. Sulu et Chekov semblent s'être
ralliés à Sybok qui entreprend alors de convaincre Mc Coy et
Spock. Pour rallier les gens à lui, il utilise ses capacités
mentales afin de soulager l'esprit de son patient de la plus grosse douleur
qu'il a en lui. Une fois soulagée la personne lui est tellement reconnaissante
qu'elle lui reste fidèle. Il délivre ainsi Mc Coy du difficile
souvenir de la mort de son père. Il était atteint d'une maladie
incurable et très douloureuse. Le Dr McCoy prit un jour la décision
de mettre fin toute assistance médicale et de le laisser mourir pour
qu'il ne souffre plus. Quelques temps après, un remède était
trouvé ! Pour Spock, le souvenir douloureux est celui de sa propre
naissance. Alors que Sybok se dirige vers Kirk, ce dernier refuse tout contact
sachant pertinemment ce que Sybok va trouver : la mort de son fils David (cf
"Star Trek
III : A la recherche de Spock").
L'
Enterprise-A parvient finalement à traverser la barrière
d'énergie du coeur de la galaxie et arrive à proximité
d'une planète inhabitée. Un Oiseau de Proie le suit, camouflé.
Il est dirigé par un capitaine Klingon qui brûle d'envie de réaliser
une haut fait d'arme en tuant Kirk.
Kirk, Spock, Sybok et les trois ambassadeurs se téléportent
à la surface. Un visage géant se forme devant eux et déclare
qu'il est Dieu et qu'il a besoin de l'
Enterprise-A pour quitter le
coeur de la Galaxie. Sceptique, Kirk le défie. Dans sa fureur, le "Dieu"
tue Sybok et pourchasse Kirk. Pendant ce temps, les autres débarqués
se font téléporter par l'Oiseau de Proie. Alors que Kirk est
sur le point d'être tué, l'Oiseau de Proie apparaît face
à Kirk et tire ... sur la créature, la détruisant. A
bord du vaisseau, le général Korrd a fait valoir son rang pour
prendre le commandement du vaisseau et sauver Kirk au lieu de le tuer. Après
cette mission, Kirk repart pour une mission de cinq ans avec tout son équipage,
sauf Sulu qui est nommé capitaine de l'
Excelsior en 2290.